bbsunchen
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最新评论
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hanmiao：
CSDN 博客地址是这個？http://blog.csdn.n ...
将博客搬至CSDN -
chenwq：
下载了，谢谢分享！
R语言学习入门 -
bbsunchen：
今天跟英姐聊天，她verbal考了151，不够啊，数学也不高。 ...
跟我一起考GRE（三） -
bbsunchen：
qinger说得对我今年只做三件事情：考好GRE，考好TOEF ...
IT行业成功必备的素质 -
bbsunchen：
还有8天就考试了，哥还在过单词啊
跟我一起考GRE（三）
文章列表
一天水了两题，呵呵，题目确实挺水的
做完上一题，这一题已经毫无难度可言了，只改了点代码
诸位凑合看：
/*
ID: bbsunch2
PROG: dualpal
LANG: C++
*/
#include <iostream>
#include <fstream>
#include <string>
#include <vector>
#include <stdlib.h>
using namespace std;
string changeBase(int formerNum, int baseN ...
这题很容易的，依然是暴力搜索，好吧，这一章都叫complete search
要点就两个，一个是进制转换，一个是ASCII码转换（当然你要想用数组来搞也是没什么问题的）
难道就是在告诉你，暴力搜索才是你最需要care的么？！
下面上我的代码：
/*
ID: bbsunch2
PROG: palsquare
LANG: C++
*/
#include <iostream>
#include <fstream>
#include <string>
#include <vector>
#include <stdlib.h ...
这次一直没过的是，C++的char转int，
要用这一句
int rightNum = (int)num[i] - 48;
一定要减去48才行。。调了一会儿才发现
下面是源码
/*
ID: bbsunch2
PROG: namenum
LANG: C++
*/
#include <iostream>
#include <fstream>
#include <string>
#include <vector>
#include <stdlib.h>
using namespace std;
...
昨天正式接受了宾夕法尼亚州立大学（宾州州立大学）的计算机系offer，写此文纪念一下。
之前一直在多个offer之间纠结，虽然对计算机比较渴望，但是也担心自己会做不好这方面的内容。因为一直以来总感觉数学是自己的弱项，而在各种算法比赛中的表现也不是太优秀。因此为了长远的发展选择了生物领域，在研究生院的时候各种数学考试也是表现得很一般，申请的时候都实在是不忍心选择计算机系（事实上最后只碰巧申请了Penn State这一所计算机系）。
在国科大的三年可以算作是水掉的三年，从一开始转专业之后就开始迷茫，后面终于有机会能够和师兄一起合作的时候却总是因为 ...
/*
ID: bbsunch2
PROG: transform
LANG: C++
*/
#include <iostream>
#include <fstream>
#include <string>
#include <vector>
using namespace std;
vector<vector<char> > rotate90(vector<vector<char> > formerMatrix, int num)
{
vector<ve ...
/*
ID: bbsunch2
PROG: milk2
LANG: C++
*/
#include <iostream>
#include <fstream>
#include <string>
#include <map>
using namespace std;
int main() {
ofstream fout ("milk2.out");
ifstream fin ("milk2.in");
map<int, int> star ...
This is a C++ demo for pan-genome analysis, by bbsunchen:
/*
start:2012/06/11 by sunchen
amend:
1.2012/06/12 by sunchen
construct a array of 2^n
conculate
2.2112/06/12 by sunchen
introduce multithread model
3.2012/06/18 by sunchen
change multithread model
complete pangenome calc ...
绦虫基因组研究方法
- 博客分类：
- bioinformatics
今天跟一个同学讨论了绦虫基因组研究方法，同时我也看到一些同学在用这套策略做枸杞的基因组，我想这应该是真核生物基因组分析一些常用的策略。简要记录一下：
首先是基因预测，有三类方法：1. denove从头预测，比如基于ORF，马尔科夫模型等 2.通过转录组数据，mapping到基因组上 3.与nr数据库等比对，blastp等做一下序列的同源比较就可以了
常用的软件有glimer等
然后预测基因的家族，用treefarm
然后与相近的物种做一个进化树，可以选用28S 18S 58S之间的保守序列做进化树，当然这些编码28SrRNA 18SrRNA 58SrRNA的基因也很保守 ...
最近学python做高精度运算。
虽然网上有很多高精度运算的算法，可是用了一个O(n^2)的算法，C++竟然运行了半个小时，坑爹。
今天发现，python是跟我一年生的，1989，属蛇。而python的翻译也是蟒蛇。真是太巧了!
下面这篇文章是说怎么在eclipse中运行python：
PyDev 简介
2003年7月16日，以 Fabio Zadrozny 为首的三人开发小组在全球最大的开放源代码软件开发平台和仓库 SourceForge 上注册了一款新的项目，该项目实现了一个功能强大的 Eclipse插件，用户可以完全利用 Eclipse 来进行 Python 应用程序 ...
最近在处理一批数据，10的8次方，处理完毕大概要一个月，并且这个程序占用的CPU只有一个（我从来没有注意到这个问题啊啊啊）。
突然师兄提醒我可以把10的8次方条数据拆成10个10的7次方，作为10条任务并行处理，我艹，三天就跑完了啊，坑爹呢这是我之前怎么没想到呢混蛋！！
以后单任务的程序一定要注意下CPU的使用情况。
并行处理也有个简单的方法，就是把原始文件给切割后提交，让队列调度程序给你并行调度就ok了。大家不要拍砖啊，这个玩意儿还是挺有用处的。
下面这个破脚本，哦，是perl脚本，用来切割文件的。我这里讲某个文件切割成，每4000条数据一个文件，每1000个文件一个文件夹 ...
IT行业成功必备的素质
- 博客分类：
- Brain Storm
这篇文章原文名称：
Skills and Attributes that Contribute to Success in Science or Engineering
也就是
科学和工程领域成功的必备素质
或者
理工科成功必备素质
迁移到ITeye上，我觉得我的标题更加合适。
有用的地方我都给出了翻译，并且给出了英文。
觉得英文费劲的童鞋可以从我标红色字体的地方开始看。从红色部分我都给出了翻译。
前面这些主要说人最重要的是应该明白自己的潜力在哪里。
Graduate education is a process by which
indivi ...
和师姐的一次谈话
- 博客分类：
- Brain Storm
sunova 10:23:47
ok
sunova 10:27:28
actually, i screw it up。
sunova 10:27:43
在基因组所我搞砸好多事情
寒萧 10:28:03
呵呵是吗？
寒萧 10:28:05
不应该呀
sunova 10:27:55
本来想着考完试找你聊聊
寒萧 10:28:10
我觉得你做事情很认真的
sunova 10:28:03
我总想不通
寒萧 10:28:59
什么想不通呀？
寒萧 10:29:22
你做事情的态度和能力我觉得没有任何问题，按理说不能搞砸事情的。
sunova 10: ...
跟我一起考TOEFL（一）
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- 留学
GRE考试已经临近了，一切都在按部就班地进行着。
接下来毫无疑问要开始考TOEFL，今天想谈谈TOEFL口语怎么准备。
今天在地铁上挺两个人用英语在谈话，基本上可以一字不差地听懂，我想大概是平时美剧看太多了吧。可是谈到口语，从自己跟外国人交流的经验，以及上次考TOEFL口语的经验来看。难点在于长时间的表述。 将所有要说的话整理并一次表述出来，或者长时间地直接用英语表述，而不出现突然忘记一个表达方式或词汇。
好了，有问题就会有解决方案的。
关于积累--困境与抉择の感
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- Brain Storm
写在前面的话：
这篇文章很早之前就看过。“人生是个积累的过程”，是对我影响颇为深远的一个思想。在这里我想将这个思想分享给大家，也想将这篇文章分享给大家。
我想，这篇文章的意义更多不在于让你不计较眼前 ...
Endnote数据库受损恢复方法
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- Brain Storm
今天打开Endnote数据库，发现文件受损，用Endnote的恢复按钮也无法恢复。
在网上找了些方法，恢复成功，具体方法是：
1.假设待恢复数据库为OldData.enl
2.新建新的数据库，假设为NewData.enl
3.复制OldData/rdb/目录下的refs.* 和 jetrm.*的文件到NewData的相应目录下
4.复制OldData/PDF目录下的所有文件到NewData的相应目录下
即可。
jterm三个文件似乎是控制文献的格式refs三个文件显然就是控制的文献的摘要
注意不能全部复制，会报错 Endnote Error